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液滴式文库构建工作站

【来源: | 发布日期:2023-09-05 】

仪器名称

液滴式文库构建工作站

使用模式

预约

计费类型

按时收费

仪器型号

GCG-SR-1

生产厂家

10×genomic

购置时间

2019/12/31

所属类型

单分子测序

所属单位/分组

组学技术平台

放置位置

第五实验楼504

仪器管理员:

万绍贵

仪器介绍

1.仪器介绍:主要应用于针对干细胞的单细胞样本自动化制备定点片段文库,建立快速、廉价、高通量的单细胞RNA-seq方法,并进行长片段基因组测序,在全基因组范围内进行染色体定相(phasing)和结构变异的研究,结合后续的基因高通量测序及遗传分析分型的一系列过程,从基因水平上阐明细胞个体之间的差异。

2.仪器参数

2.1技术指标

1、系统一次可以产生一百万个独立的液滴反应体系;

2、系统提供四百万种不同的标注;

3、样本处理通量:每次8个样本,满足平行实验的要求;

4、提供单细胞应用相关试剂盒;

5、单次实验可以测定1000-10000个细胞的转录组,获得每个细胞的基因表达信息;

6、 细胞回收效率:65%以上;

7、测序结果中doublet比例每1000个细胞不>1%;

8、可检测T细胞/B细胞单细胞水平的V(D)J全长序列测序;9、系统提供Illumina兼容测序文库,建库样本满足illumina测序仪要求;

10、数据质量:获得和illumina其他建库方式类似的数据准确性,Q30>75%。