赣南医科大学科研中心是我校基础研究和对外合作服务的大型公用平台，负责全校主要科研实验室的安全、培训、大型仪器共享及技术平台建立、运行等业务。目前科研中心主要管理蓉江校区第五实验楼（科研楼）、实验动物中心以及正在建设的科技大楼。
（1）科研楼。位于蓉江校区第五实验楼，整体为六层建筑，总建筑面积5521.84㎡。一楼为赣南医学院油茶中心，也是化学分析检测技术平台，拥有ICP-MS、HPLC-MS、GC-MS、核磁共振、傅里叶红外光谱仪、紫外光谱仪、高效微波消解仪等大型仪器设备。二楼为公共技术平台，包括流式分析、图像分析和病理学技术平台。平台的仪器主要有流式细胞分析仪、流式细胞分选仪、激光共聚焦、倒置荧光显微镜、小动物成像仪、组织脱水机、石蜡包埋机、石蜡切片机、冰冻切片机、组织切片扫描仪及激光捕获仪等。三楼为神经生物学技术平台，平台的仪器主要有膜片钳系统、步态分析系统、小动物轨迹分析系统、电子触觉测量仪、疼痛甩尾仪、肢体肿胀测量仪、冷热板测痛仪、水迷宫、恐惧箱等。四楼为赣南医学院心脑血管疾病防治教育部重点实验室( )。五楼为赣南医学院炎症与免疫中心及分子病理中心，也是组学分析技术平台。平台的仪器主要有毛细管电泳仪、纳米孔测序仪、数字PCR仪等。六楼为江西省医用组织工程材料与生物制造重点实验室及干细胞临床转化中心(基础研究分部)。也是材料分析技术平台。
（2）实验动物中心。位于蓉江校区科研动物楼，建成于2012年，整体为三层建筑，总建筑面积2191㎡，总投资约1200万元。一楼主要为普通动物饲养区、科研试验动物室中央监控室、培训室和机房等辅助区。二楼为主要动物实验区，总面积700㎡，洁净区430㎡。用于清洁级和SPF级大（小）鼠及转基因小鼠和免疫缺陷小鼠等动物实验。三楼为清洁级和SPF级大小鼠繁育区，总面积700㎡，洁净区450㎡，主要用于生产清洁级和SPF级别大（小）鼠。实验动物中心能进行普通动物，清洁级和SPF级动物的饲养、繁育、生产和相关动物实验。已经取得了清洁级SD大鼠和BALB/C小鼠的生产许可证和清洁级动物的使用许可证，同时也在进行转基因小鼠的饲养、繁育工作。实验动物中心也是赣南医学院实验动物技术平台，从事动物的疾病模型建立，正在建立基因编辑的技术。
（3）科技大楼。建筑面积10909.75㎡，计划投入使用面积6800㎡，包括负一楼至七楼，共八层。负一楼为生物样本资源库、供电保障区域、废水处理区域、废弃物暂存间、洗涤及高压灭菌室等，主要用于低温冰箱、超低温冰箱、液氮罐、蜡块切片、重点仪器等存放，以及整栋楼的供电保障、废水处理、废弃物暂存、洗涤、高压灭菌等。一楼包括分子结构分析技术研发部、微纳结构分析技术研发部、科研成果展示区以及危化品储藏区。二楼包括分子与细胞分析技术研发部、形态学实验技术研发部、基因编辑技术研发部等，用于细胞生物学研究平台设备存放及预约使用，以及PI团队和小型课题组办公及实验。三至七楼预计用于科研团队研究工作提供实验室和办公室。
组织框架：
科研中心为学校正处级单位，有中心主任和副主任岗位各1个，下设办公室、现代仪器学教研室（对外合作部）和实验动物中心三个科级机构。共有管理人员30余名。
人员：
（1）黄启同科研中心副主任，负责中心工作
黄启同为博士、硕士生导师、江西省青年井冈学者、福建省高校杰出青年科研人才。目前主要从事药物分析，致病菌检测以及纳米治疗等方向研究。主持国家自然科学基金目、江西省自然科学基金等项目10余项，近年来以第一作者或通讯作者发表SCI论文16篇。
（2）唐建红 科研中心实验动物中心主任，负责实验动物中心的安全、运行管理和实验动物技术平台的建立
唐建红为博士、硕士生导师、江西省实验动物学会理事。2012年6月在江西农业大学取得动物医学本科学士学位；2017年6月在江西农业大学获得动物遗传学博士学位（导师：黄路生院士）。主要从事实验动物种质资源创制和改进，心脑血管疾病分子机制解析。目前主持省教育厅基金1项，赣州市科技局重点研发项目1项。发表SCI论文6篇，第一作者或通讯作者发表3篇。