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纳米孔测序仪

【来源: | 发布日期:2023-09-05 】

仪器名称

纳米孔测序仪

使用模式

预约

计费类型

按时收费

仪器型号

GridION

生产厂家

Oxford

购置时间

2022/6/1

所属类型

三代测序

所属单位/分组

组学技术平台

放置位置

第五实验楼504

仪器管理员:

万绍贵

仪器介绍

1.仪器介绍:单分子纳米孔测序仪,利用最先进的纳米孔测序技术,实现对DNA和RNA分子的高通量单分子实时测序,无需通过PCR 扩增,样品无需荧光标记。可有效避免由于PCR扩增和荧光标记产生的偏离和原始样本的失真。

2.仪器参数

2.1 仪器性能

1)起始样品量:10pg~5ug;

2)测序样品上样量:75ul、≥50ng;

3)测序速度:450bp/s(DNA)、70bp/s(RNA);

4)运行时间:1min~72hrs(可控);

5)芯片使用寿命:72 hrs;

6)运行数:1~5个独立的flow cell实验;

7)功率:650W

2.2性能指标

1)文库制备时间:10min~2hrs;

2)获取序列时间:运行≥2min、实时;

3)序列条数:20 Million(百万)reads(以10kb长度计算);

4)读长长度:200bp-2Mb;

5)测序数据产量:50~150 Gb/run(30 Gb/flow cell);

6)碱基质量:99%;

7)碱基修饰:直接检测碱基修饰信息(甲基化检测);

8)分析工具:≥30种开源;

9)可完成原始电信号碱基读取(Fast5→FastQ)、数据质量控制(QC)、barcode拆分(Demultiplexing)、序列比对(Alignment)、基因组组装(Assembly)、宏基因组分析(Metagenomics)、扩增子分析(Amplicon)、测序错误校正(Error correction)、变异分析(Variant calling)、碱基修饰(Base modification)